李世民征求秦王府幕僚們的意見，大家都說：“齊王兇惡乖張，是終究不愿意事奉自己的兄長的。
近來聽說護(hù)軍薛實(shí)曾經(jīng)對齊王說：‘大王的名字，合起來可以成為一個(gè)唐字，大王終究是要主宰大唐社稷?！R王歡喜地說：‘只要能夠除去秦王，奪取東宮太子之位就易如反掌了?！?
他與太子謀劃作亂還沒有成功，就已經(jīng)有了奪取太子之位的心思。作亂的心思沒有滿足，又有什么事情做不出來呢！假使這兩個(gè)人如愿以償了，恐怕天下就不再歸大唐所有。
以大王的賢能，捉拿這兩個(gè)人就如拾取地上的草芥一般容易，怎么能夠?yàn)榱诵攀仄シ虻墓?jié)操，而忘了國家社稷的大事呢！”
李世民仍然沒有決斷，大家又問道：“大王認(rèn)為舜是什么樣的人呢？”李世民答道：“是圣人。”
大家說：“假如舜帝在疏通水井的時(shí)候沒有躲過父親與弟弟在上面填土的毒手，便化為井中的泥土了；
假如他在涂飾糧倉的時(shí)候沒有逃過父親和弟弟在下面放火的毒手，便化為糧倉上的灰燼了，怎么還能夠讓自己恩澤遍及天下，法度流傳后世呢！所以，舜帝在遭到父親用小棒笞打的時(shí)候便忍受了，而在遭到大棍笞打的時(shí)候便逃走了，這大概是因?yàn)樗吹坌睦锼氲氖谴笫掳 ！?
李世民命人算卦以卜吉兇，恰好秦王府的幕僚張公謹(jǐn)從外面進(jìn)來，便將占卜的龜殼奪過來扔在地上，說：“占卜是為了決定疑難之事的，現(xiàn)在事情并無疑難，還占卜什么呢！
如果占卜的結(jié)果是不吉利的，難道就能夠停止行動(dòng)了嗎？”于是便定下了行動(dòng)計(jì)劃。
李世民命令長孫無忌秘密地將房玄齡等人召回，房玄齡等人不答應(yīng)回秦王府，說道：“陛下敕書的旨意是不允許我們再事奉大王的。如果我們現(xiàn)在私下去謁見大王，肯定要因此獲罪而死，因此我們不敢接受大王的教令！”
李世民發(fā)怒，對尉遲恭說：“房玄齡、杜如晦難道要背叛我嗎！”
他摘下佩刀交給尉遲恭道：“明公前去察看一下情況，如果他們果真沒有回來的意思，可砍下他們頭回來見我?！?
尉遲恭前去，與長孫無忌一起明示房玄齡等人說：“大王已經(jīng)將行動(dòng)的計(jì)劃決定下來了，眾位明公應(yīng)該速去秦王府中共議大事。
我們四個(gè)人不能在街道上同行?！庇谑敲罘啃g和杜如晦穿上道士的服裝，與長孫無忌一同進(jìn)入秦王府，尉遲恭則經(jīng)由別的道路也來到了秦王府。
秦王密奏
六月初三己未日（626年7月1日），太白金星再次在白天出現(xiàn)在天空正南方的午位。傅奕秘密上奏道：“金星出現(xiàn)在秦地的分野上，這是秦王應(yīng)當(dāng)擁有天下的征兆?！?
高祖將傅奕的密奏給秦王世民看。于是這樣，李世民乘機(jī)秘密上奏父皇，告發(fā)李建成和李元吉與后宮的嬪妃淫亂，而且說：“兒臣絲毫沒有對不起皇兄和皇弟，現(xiàn)在他們卻打算殺死兒臣，這簡直就像要替王世充和竇建德報(bào)仇。
如今我快要含冤而死，永遠(yuǎn)地離開父皇，魂魄歸于黃泉，如果見到王世充諸賊，實(shí)在感到羞恥！”
高祖望著李世民，驚訝不已，回答道：“明天朕就審問此事，你應(yīng)該及早前來參見朕?！?
張婕妤暗中得知了李世民密奏的大意，急忙告訴李建成。
李建成將李元吉召來商議此事，李元吉說：“我們應(yīng)當(dāng)管好東宮和齊王府中的士兵，托稱有病不去上朝，以便觀察形勢。”李建成道：“宮中的軍隊(duì)防備已很嚴(yán)密了，我與皇弟應(yīng)當(dāng)入朝參見，親自打聽消息?！?于是二人決定先入大內(nèi)皇宮逼高祖表態(tài)。
不料在宮城北門玄武門執(zhí)行禁衛(wèi)總領(lǐng)常何名為太子親信，實(shí)際上卻從武德二年起就隨李世民出征，武德七年的時(shí)候奉李世民的命令進(jìn)入長安，領(lǐng)軍玄武門，并收買禁軍 ，因此宮中衛(wèi)隊(duì)已經(jīng)倒向秦王，李建成和李元吉卻不知道，還以為宮中都還是自己人。
武德九年六月初四庚申日（626年7月2日），李世民率領(lǐng)長孫無忌、尉遲恭、侯君集、張公謹(jǐn)、劉師立、公孫武達(dá)、獨(dú)孤彥云、杜君綽、鄭仁泰、李孟嘗（一說為長孫無忌、尉遲恭、房玄齡、杜如晦、宇文士及、高士廉、侯君集、程知節(jié)、秦瓊、段志玄、屈突通、張士貴）等人入朝，并在玄武門埋下伏兵。
李建成、李元吉二人不知底細(xì)，也一起入朝，騎馬奔向玄武門。此時(shí)，高祖已經(jīng)將裴寂、蕭瑀、陳叔達(dá)、封德彝、裴矩等人召集前來，準(zhǔn)備查驗(yàn)這件事情了。
李建成、李元吉來到臨湖殿，察覺到了變化，立即掉轉(zhuǎn)馬頭，準(zhǔn)備向東返回東宮和齊王府。
李世民跟在后面呼喚他們，李元吉心虛，先張弓搭箭射向李世民，但由于心急，一連兩三次都沒有將弓拉滿，箭沒有射中。李世民卻搭弓射向李建成，將他射死了。
尉遲恭帶領(lǐng)騎兵七十人相繼趕到，他身邊的將士用箭射中了李元吉，李元吉跌下馬來?？删驮诖藭r(shí)，李世民的坐騎受到了驚嚇，帶著李世民奔入玄武門旁邊的樹林，李世民又被林中的樹枝掛住，從馬上摔下，倒在地上，一時(shí)爬不起來。
李元吉迅速趕到，奪過弓來，準(zhǔn)備勒死李世民，就在這時(shí)尉遲恭躍馬奔來大聲喝住了他。李元吉知道不是對手，趕緊放開李世民，想快步跑入武德殿尋求父皇庇護(hù)，但尉遲恭快馬追上他，放箭將他射死了。
太子李建成的部下、翊衛(wèi)車騎將軍馮立得知建成身死，嘆息道：“難道能夠在太子生前蒙受恩惠而太子一死便逃避禍難嗎！”
于是，他與副護(hù)軍薛萬徹、屈直府左車騎謝叔方率領(lǐng)東宮和齊王府的精銳兵馬兩千人，急馳趕到玄武門，準(zhǔn)備為太子和齊王報(bào)仇。張公謹(jǐn)臂力過人，他獨(dú)自關(guān)閉了大門，擋住馮立等人，馮立等人無法進(jìn)入。
云麾將軍敬君弘掌管著宿衛(wèi)軍，駐扎在玄武門。他挺身而起，準(zhǔn)備出戰(zhàn)，與他親近的人阻止他說：“事情未見分曉，姑且慢慢觀察事態(tài)的發(fā)展變化，等到兵力匯集起來，結(jié)成陣列再出戰(zhàn)，也為時(shí)不晚?！?
敬君弘不聽從，便與中郎將呂世衡大聲呼喊著向敵陣沖去，結(jié)果全部戰(zhàn)死。把守玄武門的士兵與薛萬徹等人奮力交戰(zhàn)，持續(xù)了很長時(shí)間，薛萬徹擂鼓吶喊，準(zhǔn)備進(jìn)攻秦王府，將士們大為恐懼。
此時(shí)，尉遲恭提著建成和元吉的首級(jí)給薛萬徹等人看，東宮和齊王府的人馬頓失戰(zhàn)心，迅速潰散，薛萬徹與騎兵數(shù)十人則逃入終南山中。馮立殺死敬君弘后，對部下說：“這也可以略微報(bào)答太子殿下了。”
于是，他丟掉兵器，落荒而逃。 至此，政變以秦王李世民的勝利而告終。