話說自從神農氏自從繼承人皇之位以后，兢兢業業，凡事親力親為，以身作責，并且推廣自己以前在有姜部落的一些做法，將耕種五谷的方法傳播到各個部落。至此五谷開始在全人族部落開始種植。
人類學會種植五谷后，人族的食物危機解決了，而且有了多余的糧食，但是許多吃不完的糧食卻因為保存不好而毀壞。雖然以前伏羲的時候部落里也同樣蓄養一些吃不完的獵物，但是大多數獵物難養而且兇猛，容易傷人。
神農又從這些獵物中選出了豬、牛、馬、羊、狗、雞等溫馴好養的六種動物在整個人族部落進行蓄養，族人們便將其統稱為“六畜”。從此六畜便進入了家養的時代，族人多余的糧食也可以用來蓄養六畜而不至于因保存不好而毀壞了，而人們也不需要經常因為肉食而去打獵了，大大減少了不必要的傷亡。
從此人們不再缺少食物，并且還有剩余，有些部落或人家有時剩余多了不但自己吃不完而且六畜也同樣吃不完又不能長期保存，無奈只得扔掉，浪費不已。神農針對這個問題特意召開大會征求眾大臣的意見，最后終于想出了一個辦法，仿造以前自己在有姜部落的做法，在各個部落里開設了集市，并且在陳都更是建了一整條街的大集市。
如此人們有多余的物品便拿到集市里互相交換自己認為值得和有用的東西，不僅大大減少了浪費，更將之用在了有用的地方，而且各個部落間也開始有了商品交易，大大加強了部落間的聯系和交流。
那時候人族還是仍然采用淄衣氏發明的獸皮裹身，而神農氏在尋找五谷中發現有一種叫麻的植物，可以治麻為布，制作衣裳，穿著卻是比獸皮舒服，而且也比獸皮容易得到，于是將之推廣，從此人們開始用麻布來做成衣裳，不用再穿獸皮，逐漸走出愚昧！
自從伏羲氏發明了陶塤、琴瑟等樂器以來，人們除了生產開始有了自己的業余活動，但是伏羲氏發明的樂器卻是過于難學，不利于推廣，神農氏決定改進這些樂器，于是乃取東海之桐，削之為琴，結絲為弦，長三尺六寸六分，上有五弦，曰：宮、商、角、徵、羽。其聲可道天地之德，能表神農之和，能使人們娛樂，人皆謂之為神農琴也！卻是更加容易學習和推廣。
當時人族大多數人族部落烤制食物皆用手，如若不小心常會被灼傷，更是缺少盛物的器皿，神農于是將有姜部落以土制成各種可是盛裝的器皿，謂之為陶器，向全人族推廣，自此人們可以用陶器來盛食物，方便了許多。
那時人們雖然已經知道了春夏秋冬，更有了伏羲歷法，但是卻對農事作用不大，不知該在什么時候種植谷種，什么時候是收獲的季節，神農于是乃歷數年觀察四時變化，冷暖交替，在伏羲時代的歷法上加以改進，立歷日，立星辰，分晝夜，定日月，月為三十日，十一月為冬至。從此人們懂得了什么時候該是種植谷種，什么時候該是收獲，如此五谷生產大大增加了許多。
農業和畜牧業的出現，不但解決了人族的糧食問題，而且因為從此人們開始有了多余的物品，因此原始的商品交易開始了，集市也隨之出現了。如此一系列的治理措施下來，人族的生活明顯有了較大的提高，人口也增加迅速，呈現出一副比伏羲時代更加興旺的態勢。而且各個部落之間的交流更加的頻繁，大大加速了人族的發展。
神農氏管理部落，治理天下很有方法，其曰：“丈夫丁壯而不耕，天下有受其饑者，婦人當年而不織天下有受其寒者。”他以德治人，不望其報，不貪天下之財，而天下共富之。智貴于人，天下共尊之。他以德以義，不賞而民勤，不罰而邪正，不忿爭而財足，無制令而民從，威厲而不殺，法省而不煩。對百姓無有相害之心，刑政不用而治，甲兵不起而王，是以諸侯大臣盡皆擁護，百姓人人愛戴！
不過這時候人族雖然不起戰禍，但是還經常會遭受一些猛獸妖物的襲擊，于是神農發明了以木制弓，獸筋為弦，鳥翎作羽，削木為箭，武裝部分族人，以保護族人的安全。
神農見族人們的生活在他的治理下日漸好了起來，心里高興不已，走在陳都的大街小巷上，看著熙熙嚷嚷的往來族人，心中充滿了自豪感。而同時人族各個部落也都呈現出一片初興的景象。
不過這時神農也遇到了困擾，卻是神農經常得聽到有些老弱族人偶爾遇上頭痛、發燒之事仍然無法治愈，有些族人就這樣死掉了，甚至一些壯年男女發生這樣的狀況也就無法干活了，只能躺在床上等著好轉，而且這些現象現在越來越多，再就是誤食毒物或被毒蟲、毒蛇所傷的族人越來越多，人族卻是束手無策，只能眼睜睜的看著族人死去。原來當時人族不識醫藥，是以每有生病便不知如何治療，故而常有死亡。
這個問題也困擾神農許久，只是以前有太多地族中事物需要*持和處理，并沒有花太多地精力在這方面，這一問題也沒有得到有效地解決。而如今人族得大多重要事情已然解決，自己也應該想個辦法來解決這一問題。
族人們的疾苦，神農氏瞧在眼里，疼在心頭。怎樣為族人治病？神農苦思冥想了三天三夜，終于想出了一個辦法。原來神農因為找尋五谷之事，對植物相對比較了解，知道有些植物是可以治病的，可是還有更多的植物卻是有毒，而且有毒和無毒是看不出來的。于是神農便立誓走遍天下，嘗遍百草、使人們知道什么能吃，什么不能吃，哪些吃了有害，而哪些吃了有益，哪些又可以醫治什么病痛，等等。神農決定將這些記錄下來，以供人們參考。
卻說人皇神農氏既然決定要嘗百草，以身試草，讓后人知道什么可吃，什么有毒，什么病狀用什么藥來醫治，于是召集群臣，告訴眾人自己準備嘗百草之事。
群臣聽罷，紛紛大驚，匍匐在地大哭苦勸道：“不可啊，圣皇您對人族的貢獻之大，人族就是傾盡九天之水也無法償還，您的安危關乎人族命運，怎么還能讓您冒著生命危險去嘗百草呢！”
神農聽罷，哈哈一笑道：“我的安危又怎么能比得上億萬族人的安危呢。現在我的族人們正面臨著病痛的威脅，我作為人族共主又怎么能不去解決呢？”眾人苦勸，神農還是一一回絕。
眼看神農決心已定，任由眾人如何苦勸也不會更改了，有一個名為鼎光的臣子越眾而出，向神農施禮道：“圣皇您為人族共主，生身性命關乎人族的前途命運，非比尋常。既然您一定要行嘗百草之舉，我愿隨行，效圣皇圣德，為生民百姓貢獻一份力量。”
其他臣子見狀，也是紛紛要求隨行，以分擔神農的風險。畢竟神農身為人族共主，對人族至關重要，只要能夠為他的安全出一份力，眾多人族精英又何惜自身生命。神農開始不允，后來見眾人之意甚誠，也只得答應了。
第二天，神農氏帶了一批臣民，在陳都無數臣民的痛哭之下離開了陳都，向大山走去。他們走哇、走哇，腿走腫了，腳起繭了，還是不停地走，整整走了七七四十九天，來到一個地方。只見高山一峰接一峰，峽谷一條連一條，山上長滿奇花異草，大老遠就聞到了香氣。
神農他們正往前走，突然從峽谷竄出來一群狼蟲虎豹，把他們團團圍住。神農馬上讓臣民們奮力殺搏，向野獸們殺去。打走一批，又擁上來一批，一直打了七天七夜，才把野獸都趕跑了。
這時，臣民們說這里太險惡，勸神農回去。神農搖搖頭說：‘不能回！黎民百姓病了沒醫的，我又怎么能回去呢！‘他說著領頭進入了峽谷，來到一座茫茫大山腳下。
這山半截插在云彩里，四面是刀切崖，崖上掛著瀑布，長著青苔，溜光水滑，看來沒有登天的梯子是上不走的。臣民們又勸他算了吧，還是趁早回去。神農搖搖頭：‘不能回！黎民百姓病了沒醫的，還在苦苦煎熬，我們怎么能回去呢！‘
他站在一個小石山上，對著高山，上望望，下看看，左瞅瞅，右瞄瞄，打主意，想辦法。后來，人們就把他站的這座小山峰叫‘望農亭‘。
然后，他看見幾只金絲猴，順著高懸的古藤和橫倒在崖腰的朽木，爬過來。神農靈機一動，有了！他當下把臣民們喊來，叫他們砍木桿，割藤條，靠著山崖搭成架子，一天搭上一層，從春天搭到夏天，從秋天搭到冬天，不管刮風下雨，還是飛雪結冰，從來不停工。整整搭了一年，搭了三百六十層，才搭到山頂。傳說，后來人們蓋樓房用的腳手架，就是學習神農的辦法。而神農氏親自搭成的木架之所在，也就成了后世傳說中神農架的由來。
神農帶著臣民，攀登木架，上了山頂了，嘿呀！山上真是花草的世界，紅的、綠的、白的、黃的，各色各樣，密密叢叢。神農喜歡極了，他叫臣民們防著狼蟲虎豹，他親自采摘花草，放到嘴里嘗。為了在這里嘗試草藥、找醫藥，神農就叫臣民在山上栽了幾排冷杉，當做城墻防野獸，在墻內蓋茅屋居住。后來，人們就把神農住的地方叫‘木城‘。
白天，他領著臣民到山上嘗百草，晚上，他叫臣民生起篝火，他就著火光把它詳細記載下來：哪些草是苦的，哪些熱，哪些涼，哪些能充饑，哪些能醫病，都寫得清清楚楚。
有一次，他把一棵草放到嘴里一嘗，霎時天旋地轉，一頭栽倒。臣民們慌忙扶他坐起，他明白自己中了毒，可是已經不會說話了，只好用最后一點力氣，指著面前一棵紅亮亮的靈芝草，又指指自己的嘴巴。臣民們慌忙把那紅靈芝放到嘴里嚼嚼，喂到他嘴里。神農吃了靈芝草，毒氣解了，頭不昏了，會說話了。從此，人們都說靈芝草能起死回生。
臣民們擔心他這樣嘗草，太危險了，都勸他還是下山回去。他又搖搖頭說：‘不能回！黎民百姓病了沒醫的，還在痛苦中煎熬，我們又怎么能回去呢！‘說罷，他又接著嘗百草。
他嘗完一山花草，又到另一山去嘗，還是用木桿搭架的辦法，攀登上去。一直嘗了十數年，踏遍了無數的山山嶺嶺，期間也無數次的中毒，可是在自己的水晶肚和自己對藥草的理解下，最后還都是轉危為安。
可惜他還只是嘗了一部分的藥草，神農也不泄氣，他相信總有一天自己能將大部分藥草的特性都記錄下來，不過最初那些以鼎光為首的跟隨神農前來的臣民也都大半身死，沒死的那幾個也都被神農趕回去了，并且讓他們帶回去了這些年神農嘗百草所得。
這天神農來到一座名為發鳩山的大山之下。這座大山上的植物也是很多，有很多還是神農以前沒有見過的。神農欣喜之下，把一株自己以前從未見到過的小草放入了自己口中。
這草剛一入口，神農霎時間只覺得天旋地轉，猛的一下載到在了地上。
這一次的毒性雖然比神農以前中的毒要強上許多，但是以神農的水晶肚的神奇原本是不至于此的。可是這株草的毒性居然引發了神農一直以來體內混合壓制的其他毒性，無數種毒混合在一起發生了變異早已不是凡間之毒了。
神農想要像以前用各種可以解毒的藥草都試過了，可是卻都沒多少效果，腹中疼痛更甚，這感覺就好像自己的腸子斷裂開來一樣。嘗試了好幾次，結果依舊，神農只好放棄了，不過還是忍著劇痛將這一藥草記錄了下來，并命名為“斷腸草”，希望以后族人不要再搗自己的覆轍，隨后神農又深深的想到：“想不到自己居然要死在這里了，可惜自己的理想還沒有實現，還沒有幫族人們解決病痛的威脅。”
神農渾身不斷冒著冷汗，他感覺到自己的肚子像碾心一般的疼痛，腸子好象斷裂成了好幾節一般。正當神農以為自己即將喪命，意識也逐漸陷入了迷糊，隱隱約約間，突然聽到一聲嘆息的聲音傳來：“唉，為了人族之事，你受這樣的苦已經不是一次兩次了，到現在你的心中可有悔意？”
“為了族人，即使任何事情我依然不后悔。”神農在聽聞到聲音之后，雖然他無法開口說話，但還是用緊守的心神之念回答道。
“你這又是何苦，要是為了人族要讓你放棄生命與靈魂你也不悔嗎？”那個聲音再次響起。
“即使放棄生命與靈魂，我也要完成我的夢想！”神農用自己最后唯一清醒的一絲意識回答道。
“誒！癡兒。”隨后只見一個玄奧的身影出現在神農身旁，不是太上老君還是誰，原來老君在八景宮算到自己的徒弟神農氏將有一難，于是馬上趕來，這才有了剛才的一幕。
神農體內之毒便是讓大羅金仙之流來處理的話那也是相當的棘手的，可是對于作為圣人來說并不是什么難事，更何況老君更善于煉丹，很快的老君就排解了神農體內的毒性。
毒性一除，神農也沒用多久就轉醒了過來。神農清醒之后，一見自己的老師太上圣人正在自己的身邊，馬上知道了是自己的老師救自己，不敢怠慢，馬上俯首道：“不肖弟子神農多謝老師救命之恩。”
老君扶起神農，滿意的看著神農氏，淡淡道：“你很好，比我想象的做的還好！你既有此心，為師也不愿阻你，此也是你的功德。不過你雖然天賦異稟，而且還學了太清道法，可畢竟還是凡人之軀，很多藥草對你來說卻是劇毒。”
老子隨后拿出一鼎和一條色呈褐色，長有三尺六寸的神鞭給他，道：“此乃神農鼎和赭鞭，前者乃為師仿造先天靈寶乾坤鼎所制，賜你煉制丹藥只用，后者乃是為師取先天乙木之精所煉成的寶物，可辨識萬千草木，只要用此鞭打過便可知這種植物有毒無毒，卻是方便你辨別百草。”
隨后又一指神農，只見一道紫光沒入神農眉心，道：“這乃是為師億萬年來的煉丹心得，希望你能將其發揚廣大，造福萬民，為師走了。”隨后身行消失不見了。神農見到老師走了，不過還是想老君消失的方向恭恭敬敬地扣了三個頭，心中默默的道：“老師放心，神農一定不辜負您的期望。”
隨后又經過數十年的辯嘗，神農終于幾乎將所有的草木都嘗遍了，并且將這些都一一記錄了下來，此時距離神農離開陳都已經七七四十九年了，于是神農準備返回陳都對自己嘗百草得來的寶貴記錄進行整理、編撰以及傳播工作。