繼前作設(shè)定，《虐殺原形2》依然設(shè)定在紐約市，由于之前爆發(fā)的災(zāi)難，這次的紐約市被稱為零度紐約，根據(jù)感染程度不同被劃分成三個(gè)區(qū)域。曼哈頓是紅色區(qū)域，已經(jīng)被生化怪物占據(jù)。曼哈頓附近的島嶼為黃色區(qū)域。綠色區(qū)域是最安全的，這里的h私人武裝帶來(lái)的是一種別樣的恐怖氣氛。《虐殺原形2》主角已不再是1代的alex，而是新角色jamesheller，一名士兵，他要搞清楚敵人背后的計(jì)劃，而且要?dú)⑺浪膭?chuàng)造者（alex）。
虐殺原型2里面的主角是一個(gè)黑人，模樣長(zhǎng)得倒是有些威嚴(yán)，特別是兩撇眉毛，顯得格外的霸氣。而虐殺原型一里面的亞瑟卻有著一種怪異的美感，殺人都有一種藝術(shù)的味道。
相比較起來(lái)，軒轅擎天更加喜歡亞瑟這個(gè)角色，也就是虐殺原型一里面的主角。因?yàn)榕皻⒃?的jamesheller大有一種黑人的共鳴之處，那就是沒(méi)什么頭腦，只知道一味的沖殺！
至于說(shuō)虐殺原型2的背景，大概跟虐殺原型一精密相連，講述的是：冷戰(zhàn)期間，為了在洲際導(dǎo)彈所書(shū)寫(xiě)的“對(duì)等毀滅”恐怖法則下?lián)碛辛硪环N能夠高效消滅敵人有生力量的大規(guī)模殺傷武器，美國(guó)國(guó)防部高級(jí)計(jì)劃署（darpa）聯(lián)合陸軍部，于1962年6月9日秘密成立了“第一生物戰(zhàn)部隊(duì)”，代號(hào)“黑色守望”（h），總部位于馬里蘭州的翠克堡。在進(jìn)行dx-1118a生物戰(zhàn)劑的制造過(guò)程中。研究人員意外發(fā)現(xiàn)了一些擁有特殊基因的**實(shí)驗(yàn)對(duì)象會(huì)產(chǎn)生身體機(jī)能和形態(tài)的突變，高層認(rèn)為這是一種能夠制造強(qiáng)力士兵的途徑。(平南言情)從而對(duì)此展開(kāi)了針對(duì)性研究。
他們以“驗(yàn)證在核戰(zhàn)爭(zhēng)條件下設(shè)立自給自足型幸存者定居點(diǎn)”為由，在愛(ài)達(dá)荷州的河普鎮(zhèn)(hope)展開(kāi)了代號(hào)為“黑光”(blacklight)的針對(duì)性研究，許多軍人家庭在“愛(ài)國(guó)”大旗的感召下被騙往這個(gè)死亡集中營(yíng)。1969年，有意泄露的病毒找到了完美的寄生對(duì)象，懷有身孕的19歲女性伊麗莎白，而整個(gè)小鎮(zhèn)的居民則因?yàn)椴《径腥咀儺悺?
在“圓滿”完成任務(wù)目標(biāo)后。黑色守望部隊(duì)消滅了所有變種人，以及在當(dāng)?shù)蒯t(yī)院的最后一部分還未感染的居民。他們將小鎮(zhèn)夷為平地，銷毀了所有的罪惡證據(jù)，只帶走了伊麗莎白和她未出生的兒子，作為日后生化研究的寶貴財(cái)富，在觀看軍方在荷普鎮(zhèn)的“altruistic”行動(dòng)后，就連鐵石心腸的軍方高層人員也對(duì)這次慘劇帶來(lái)的駭人畫(huà)面產(chǎn)生了極端恐懼。
他們立刻下令停止在國(guó)內(nèi)進(jìn)行生物武器的開(kāi)發(fā)。以免在大城市發(fā)生類似的“事故”。同時(shí)也對(duì)黑色守望部隊(duì)的定位作出了改變：不再負(fù)責(zé)生物武器的開(kāi)發(fā)，而變?yōu)閭刹旆怄i和預(yù)防美國(guó)本土發(fā)生不明病毒爆發(fā)。
然后利欲熏心的五角大樓又不甘心紅光病毒永遠(yuǎn)被封存在地下冷凍庫(kù)中。因此，在科學(xué)家“”于1976年成立了k后，黑色守望又找到了新的合作對(duì)象。既是病毒的研究者，也是病毒的保護(hù)者。(平南言情)正是因?yàn)檫@個(gè)原因，在后來(lái)發(fā)生的“曼哈頓浩劫”中黑色守望不惜要?dú)缂~約也要控制病毒漫延的原因k基因公司的創(chuàng)建者因?yàn)楦杏X(jué)自己的合作對(duì)象，美**方似乎一直在向自己隱藏關(guān)鍵信息，所以他以中止合作作為威脅。換取了所有的機(jī)密資料，以及整個(gè)實(shí)驗(yàn)的核心研究對(duì)象－－－幾十年來(lái)一直處于冰凍狀態(tài)的伊麗莎白。于是，“紅光”病毒的進(jìn)化穩(wěn)定版本，“黑光病毒”得以出現(xiàn)并進(jìn)行更完善的研究。
然后即使在k內(nèi)部。也只有極少數(shù)高層人物了解這一項(xiàng)目的真實(shí)目的。基層科學(xué)家們只知道自己所研究的是一種能夠促進(jìn)身體組織和器官快速愈合的新藥，用于治療那些嚴(yán)重影響人類生命健康的不治之癥，卻不知道自己的研究成果已被另一個(gè)秘密團(tuán)隊(duì)（d-code）小組拿走，還制造了161名沒(méi)有自主意識(shí)的基因超級(jí)士兵。
在研發(fā)過(guò)程中，項(xiàng)目小組的首席科學(xué)家亞歷克斯博士對(duì)于實(shí)驗(yàn)過(guò)程中造成的大量動(dòng)物死亡，以及高達(dá)14種人造病毒株的事實(shí)產(chǎn)生了疑惑。出于公眾安全和社會(huì)責(zé)任考慮，他攜帶了一個(gè)病毒植株作為證物，準(zhǔn)備將k和軍方的罪惡計(jì)劃向世人公布，然而因?yàn)橥碌母婷埽瑏啔v克斯在賓州車站與趕來(lái)攔截的黑色守望士兵發(fā)生沖突并被逼入絕境。
走投無(wú)路的亞歷克斯摔碎了罐體，導(dǎo)致整個(gè)曼哈頓島被感染，自己也被高濃度的黑光病毒所吞噬。不過(guò)幸運(yùn)的是，黑光病毒無(wú)法通過(guò)水和空氣傳播，因此哈德遜河阻隔了病毒向紐約市中心的擴(kuò)散。同時(shí)，在k實(shí)驗(yàn)室，本應(yīng)該已經(jīng)中槍死亡的亞歷克思卻慢慢蘇醒過(guò)來(lái)。這時(shí)的“他”已經(jīng)不是人類，而是作為“黑光”第一個(gè)感染的人類的人格化的宿主，也就是原型體（ype）。
因?yàn)槿祟惖膩啔v克斯已死，所以此時(shí)的原型體空有亞歷克思的人格，外貌，卻喪失了原來(lái)的全部記憶。蜂擁而來(lái)的黑色守望士兵讓亞歷克思了解到自己是人人欲誅的重要目標(biāo)，同時(shí)也發(fā)現(xiàn)了自己擁有常人不可能擁有的“超能力”。所以他更想知道“我是什么”而不是“我是誰(shuí)”。
在利用自己的能力吸收了數(shù)名bw高級(jí)官員的記憶之后，原型體亞歷克斯也了解到自己不是人的事實(shí)已經(jīng)這一切慘劇的內(nèi)幕。真相大白讓亞歷克斯陷入了短暫的迷失，然后他并沒(méi)有將接下來(lái)的時(shí)間用來(lái)思考人生，而是著手開(kāi)始了“救贖”式的行動(dòng)。