雖然通天爲人教教主，佔了先機，但人皇降世，乃是天機，無緣不可得。而神農又不同於伏羲有人教功法氣息，因此通天也只能大概算出神農將於近段時間內出生在有姜部落，因此通天趕緊搶先下手。
通天很快就來到了有姜部落，此次通天爲了避免麻煩，就化爲一個平常人的面貌，很快，通天就聽聞了一個神異的事件，卻是部落裡有一名女子叫任姒，任姒一日遊華山，看見一條神龍，身體馬上有反應，就此受孕，部落里人用伏羲八卦皆推算不出，都驚恐不已。
通天一算，不禁一笑：真是皇天不負有心人啊，於是就顯出真身，並告訴有姜部落任姒所懷之人日後將爲洪荒第二人共主。於是通天便住在有姜部落，傳下人教道統，順便了解一下遠古洪荒人族的生活，但他對人族的文明發展卻甚少干預，畢竟人族有自己的發展歷程，只有人族自力更生，才能真正立足於洪荒。
聖父留在有姜部落，並且有姜部落將出大賢的消息，很快就傳遍了出去，周圍人族部落聽聞，盡皆搬遷而來，有姜部落漸漸成爲了人族第二大部落。
任姒懷孕十年後，懷中小孩終於問世，通天便賜名爲神農，收神農爲第五位記名弟子。有姜部落大肆慶賀後，通天便帶著神農回蓬萊島。
而此時伏羲卻焦急不已，原來八卦得以流傳後，人們通過推算，可躲避大自然的災害，又有許多人在人教傳道下，學得法術或從八卦中領悟出神通，可抵禦猛獸，於是人族沒了大自然的威脅，死亡率大大降低，因此數量越來越多，漸漸的，通過打獵捕魚、採摘野果的方式便不能滿足衆人的吃食要求了。人族開始出現饑荒，伏羲雖然可用道法解決一時之需，但這終究不是長久之計，伏羲對此也沒有什麼辦法。
而且如今伏羲大道已成，修爲日漸高深，已經明瞭天數，隱隱感覺到自己能留在人族的日子不多了，於是伏羲就開始尋找可以接替自己位置的人，來解決人族的食物事宜。
碧遊宮。
通天坐在雲牀上，欣慰地看著下面站著的神農。
神農也不愧爲天命之人，對於農事和丹藥之術悟性奇高，並且資質極佳，短短十多年，就有了大羅金仙初期的修爲，讓衆弟子再次驚呼大嘆。
通天拿出一個三腳鼎和一條鞭遞給神農，說道：“此鼎名爲神農鼎，乃是爲師仿乾坤鼎所煉，可煉百草精英，這鞭名爲赭鞭，乃是爲師用造人之葫蘆藤所煉製的，可辨識萬千草木，只要用此鞭打過便可知草木有毒無毒，但卻無法辨別出毒性之強烈，你有大志，此二物便給你防身！”當然通天所煉之物又豈會如此雞肋，這神農鼎和玄木的盤古鼎功用相似，皆攻防一體，而赭鞭更爲了得，威力不小，可以無視一切法術、肉體、精神攻擊，直接拿人，而且是功德聖器，傷人不沾因果。
神農感受這二物無形中散發而出的陣陣威壓，不禁一陣激動。
通天又遞給神農一根紫竹杖後，嚴肅地說道：“你和你師兄伏羲一樣，你們的道皆在於人族，你回人族後，切記時刻心繫百姓，以造福洪荒萬民爲己任。還有你之所學和玄木相似，日後若有難題，你可問玄木。”
通天想了想，取出一顆丹藥，對神農道：“這爲混沌丹，可解百毒，日後你用到之日，便是你功成之時。”
神農有些疑惑，接過後，便出了蓬萊島，回到有姜部落。
有姜部落衆人見神農爲聖父之徒，又本領高強，因此在首領衰老之後，便推舉了神農爲新的部落首領。
神農在接任首領之位後，勵精圖治，但隨著族人的數量越來越多，糧食很快就嚴重不足，於是神農便每天思考如何解決族人的吃飯問題。
神農很是聰穎，又對農業之事極爲精湛，一天，神農看到牛馬等動物在吃草，心中一動，不由得心想動物可靠吃草而活，那麼族人應該也可以。
一念之下，又想起通天所賜的神農鼎和赭鞭，神農頓時明白通天之意，將部落之事安排好後，神農便帶了幾個族中的青壯年出發，開始尋找人族可以吃的植物。
雖然蓬萊大道三卷的《雜篇》裡記載了無數的天財地寶、奇花異草，但卻沒有平常的食物藥材，因此神農只得親自行動。
神農遊歷洪荒，一路之上但凡見到以前未曾見過的草木便取一枝下來，用赭鞭打一下，查看其有無毒性，將他們一一記錄下來，並一一服用，辨別出毒草毒性之強烈，並用神農鼎將草藥煉成丹藥，將藥物的精華全部存下來。
如此數年時間，神農終於找出了許多可以食用的植物，但洪荒中有無數異物，神農因此也多次中毒，雖然神農憑藉大羅金仙的道行和豐富的藥草知識挺了過去，但卻仍留下了隱患。
有付出便有收穫，神農也因此發現了每一樣草木都有其五行屬性，相生相剋。而有些毒藥毒性劇烈卻是因爲混含了數種五行之力。神農觀察後，發現草木的根、幹、枝、葉、果功用各不相同，卻是皆有妙用，而且有些草木與人體內某些性質相似，可以用之解毒治病或者調理身體。
如此，數十年過去，神農幾乎將所有的草木嚐了個遍，這一日，神農在一座巖石下看到了一種從未見過的開著小黃花的藤狀植物，神農用赭鞭打一下發現其中蘊含劇毒，便把花和莖吃到肚子裡，霎時便感到肚子鑽心地痛，腸子好像斷裂了一般，當下一頭栽倒。
本來神農是可以將此毒抗住的，但是原本神農體內便潛伏了許多毒素，此毒又將引之了出來，數毒併發之下，神農卻是扛不住了。
跟隨在他身邊的臣民慌忙扶他坐起，神農明白自己中了毒，可是已經說不出話了，只好用最後一點力氣，指著自己的口袋。臣民慌忙將口袋裡的混沌丹，喂到他嘴裡。原來神農早就預料自己可能出事，因此將混沌丹帶在身旁，並告訴了臣民如何應付突發事件。
過了一會，神農覺得自己好了，不但體內以前留下來的毒全部化解了，而且連修爲也隨之暴漲到大羅金仙后期，神農不禁驚歎。
神農站起來向蓬萊島方向一拜，心想自己幸好有老師賜下的混沌丹，不然就會死在這裡了，神農根據毒發特徵，便將差點要了自己性命的小草取名爲斷腸草。
神農又想每天洪荒裡又有多少人因誤食而喪命，自己卻應早日整理所學，流傳以造福百姓。神農突然心中一動，卻是明白了當日通天賜下混沌丹時所說的話。於是，神農就此回到部落。
神農回到部落後，首先將可以食用的植物一一栽種，從中篩選出稻、黍、稷、麥、菽等五種適宜種植的植物，合稱五穀。
看到五穀產量不多，又經常受自然災害影響，神農又研究種植之術，他教民衆伐倒樹木，割掉野草，燒山爲田，併發明瞭鋤頭、耒耜等工具和九井相連的水利灌溉之術使得耕作大爲簡單，結束了農作物靠天而收的歷史，終於種出大量的糧食解決了饑荒。
有姜部落大量種植五穀，解決了食物問題。此事流傳出去後，其他部落聽說有姜部落不需要冒著危險去狩獵，也不需要四處採摘果實，只要辛苦一點努力耕作農田就可以填飽肚子，便紛紛舉族歸順，有姜部落更加興盛，神農的名氣也越傳越大，終於引起了伏羲的注意，於是，伏羲決定親自去有姜部落看看！
伏羲幻化成普通人模樣來到了有姜部落，只見部落裡到處種植著五穀，一派綠油油的景象。大人在田裡耕作，小孩在壟裡玩耍，人們過得幸福快樂。伏羲心中一動，當下就找了幾個人詢問，都道這是聖父和首領神農的功勞，伏羲心下甚是高興。伏羲又向人們要了些種子，揉搓後放進嘴裡咀嚼，發現極爲香甜可口，當下大是興奮。
當伏羲詢問神農的下落時，衆人都尊敬地指著一個在田裡勞作的農夫，那農夫身材魁梧，皮膚黝黑，應該是長期在田裡勞動所致，伏羲頓時對這神農感到很是滿意，隨即現出真身，找人將神農叫來，想看看神農是不是真的是有才之人，若是神農真的像傳說中那樣有才，就準備將自己的位置傳給神農。
神農聽說天下共主來了，連忙前來迎接。伏羲發現神農也有人教功法氣息，一問之下，才知道原來和自己一樣都是聖父的弟子，心念一動，頓時知道了神農乃是自己的接班人。
二人便以師兄弟相稱起來，談話也就不再拘束。談話進行得越深入，伏羲就越驚訝，神農對於如何種植莊稼極爲精通；在管理洪荒衆部落方面，神農也能推陳出新，提出許多好的見解；而神農最厲害的是草藥醫學，擅長治病救人。
伏羲不由得嘆道：“神農真爲大賢啊！”也對通天知識之淵博感到佩服。
伏羲遂又道：“今日見你，我道後繼有人矣！”
伏羲便邀請神農前去陳都，接任那人族共主之位，神農如何不從？辭別家人，找個助手接管了自己的事物，便與伏羲一起去了。
到陳都後，神農作爲伏羲的助手，處理政務井井有條，一些困難的事情也很好的解決了，慢慢的伏羲便將所有的事都交給神農處理。