確定了司長的人選之後，任思齊又從招募的讀書人中徵辟了一些書吏，幕府的架子算是搭建了起來。軍隊的事情一律先經過幕府處理，處理不了的事情或者一些大事才需要交到任思齊面前。
除了建立幕府以外，任思齊又對岱山巡檢司衙門進行了改制，在岱山巡檢司之下設立吏戶禮商刑工六曹，全面主管岱山及附屬各島民事。當然按照大明官制，小小的巡檢司下面是沒有這些機構的，可現在任思齊也不不了許多。因爲兵事完全由幕府掌管，沒設立兵曹，但多了一個商曹，畢竟現在岱山的支柱是商貿。
任命沙福爲岱山副巡檢兼戶曹主事，負責管理各島民事，掌管戶籍，屯田、賦稅徵收之事。
任命任峻爲吏曹主事，負責官吏的功過升遷監督考評。
任命鄞縣童生李克儉爲吏曹主事，掌管禮儀教化之事，並管理岱山書院。隨著移民的增多，任思齊打算在各島建立學堂，讓所有的孩童都能讀上書。
任命膠州吏員柯文哲爲刑曹主事，掌管刑獄訴訟。柯文哲爲膠州刑房司吏，是少數跟隨岱山軍南下的膠州吏員之一，熟知大明刑律。
任命陳忠爲商曹主事，負責岱山商貿之時，主管貨物買賣，罐頭工廠。任思齊把海貿貨物的購買權也給了他，當然出海貿易不需要他負責。
任命樑九爲工曹主事，掌營造，道路橋樑修建，管理各工匠鋪。樑九是任思齊這次山東之行的意外之喜，他是京師名匠馮巧的弟子，馮巧曾多次參與皇宮的建築維修。樑九老家在膠州，當滿兵攻佔北京之後，因爲北京發生了瘟疫，遂把滿城百姓趕出了北京。樑九便索性回了膠州老家。若沒有任思齊這次山東之行，很多年後，樑九會重新爲滿清效力，並主持重建太和殿。
在巡檢司之下設立六曹之後，岱山所有的民事都由巡檢司處理。設立秘書處，任命張蒹葭爲秘書長，協助自己處理民事，六曹不能決定之事需要上報秘書處，由張蒹葭負責協調，再報任思齊批準。
在幕府和巡檢司之外，另設敵情司，負責諜報工作，兼有監督官吏之責。當然目前的首要任務就是探查敵情，往各地派遣細作。敵情司的主事由安東尼擔任。
設立了幕府及重建巡檢司之後，岱山的機構總算架設完畢，各種事務以後都有專門機構處理，不用大事小情都拿到任思齊面前。
架子搭起來了，各機構的主管也都任命完畢，下一步就是確定各官吏的級別待遇。
任何一個組織要想健康發展，都必須要明確級別待遇。有了級別，就有了上下尊卑，不同的級別享受不同的待遇，這樣每一個下屬纔會有動力，纔會有奔頭。
畢竟現在有朝廷在，任思齊不敢做的太過出格，在武將系統中還是採用了明朝的官制。武將的級別分官階和官職兩部分。
官階採用明朝官階，從小旗、總旗、副百戶、百戶、副千戶、千戶，到任思齊這個遊擊將軍。
官職則爲小旗、總旗、隊正、營正、鎮將，目前岱山軍最大的建制就是鎮，一鎮由五個營組成，士兵五千餘人。
官階代表著享受的待遇，官職則是實際的職位。但在官職任命時肯定要考慮到官階。
對於文官系統，任思齊可不敢採取明朝官制了，畢竟他這個巡檢纔是從九品小官。而是採用一級職員到九級職員這種稱呼。最低級的辦事員爲九級，然後依次向上八級七級。其中職位最高的六曹主事任思齊設定爲六級，因爲他必須留出升賞的空間。
不同的級別對應不同的待遇薪水，最低級的九級職員每月能拿到二兩銀子的薪水，而六級主事則每月能拿到二十兩的銀子，還會有米麪菜蔬各種福利。
九級職員之下則是普通百姓，而想從百姓做到職員則會很難，必須有對岱山做出特殊貢獻。
剛開始建制，任思齊並沒有設立太多職員崗位，整個文官系統的職員加起來也就三十幾位。以後根據需要再進行調整。
各種任命以文書的形式發佈了出去，立刻在島中引起了轟動。當聽到身邊的某人成爲了八級職員，每個月拿到多少多少銀子以後，其他人都露出了豔羨之色。
在那些從山東而來的文人看來，建制以後，岱山不再是他們以前心中的那個草頭班子，而是隱隱有了一方勢力的架勢。
好些原來只想著乘船來岱山，然後再轉到江南其他地方的文人則在考慮著是否留下來，在岱山先謀取一個職位。
雖然岱山的職位並非大明正式的官職，可賺的銀子卻真不少。而且不用殘酷的科場考試，只需要去巡檢司報備，經任思齊考覈面試即可。只要是童生秀才功名的讀書人，還沒有見到被唰下來的，只不過各人得到的職位不同，不過最少也會是個九級職員，每月也能拿到二兩銀子的薪水。對這些背井離鄉的人來說，能有個餬口的地方已經不錯。
最令山東來的讀書人羨慕的則是李彥直，李彥直現在竟然做到了遊擊將軍幕府參謀司司長，享受六級職員待遇，算是他們這些人中最厲害的。
“將軍，經此一事，岱山數萬百姓的人心盡收矣！”巡檢司官廳之內，李彥直對任思齊讚歎道。
任思齊得意的笑了起來，他前世好歹做過公司高管的人，自然知道管理一個公司關鍵是設立完善的制度，做到人有其責，只要再建立合理的升遷獎懲規則，公司就能健康的發展下去。
如今岱山只是架子搭起來而已，各種制度才初步創立，離完善還差的很遠。
“彥直兄過譽了，這一切還只是開始而已。對了，關於新兵的訓練之事，彥直兄準備的怎樣了？”任思齊這些時日忙於架設岱山的各種機構，把練兵之事委託給了李彥直。
“正要向將軍稟告呢！”李彥直說著把一本小冊子遞到任思齊面前。