在神農的治理下，人族在幾十餘年的休養生息裡，發展極快，神農見人族發展終於進入了良好的軌道，就放心地將政務託付給衆助手，準備整理自己幾十年來對百草的嘗試、理解。
神農隨即閉關整理自己多年來試藥的經驗，幾年裡神農細心體會，慢慢琢磨，倒也寫出了不少感悟。當神農整理到煉丹之術時，卻不知應從何下手，心中一動，卻是想起了出島時通天所說。
神農就來到大平原人族大殿找玄木，玄木修爲極高，自然知道神農所爲之事。
玄木看著忙碌得兩鬢斑白的神農，敬佩不已。想了想，玄木說道：“人教門下，切忌傳法資敵，且老師所教的非同小可，傳下高深的煉丹之術對人族不一定是好事。”
神農身形一震，頓時明白過來：自己是身在局中，對人族過於關心纔會猶豫不決，自己即使傳下一般的煉丹功法，也足夠人族療毒治病之用了，若自己傳下高深的功法，後人坐享前人成果，豈不阻礙了人族自身的再摸索、再創新。
神農明白後，向玄木施了一禮，道：“多謝師兄提點。”
玄木忙回了一禮，笑道：“皆爲同門師兄弟，自當相互幫助，無需多禮。”
心中一頓後，玄木又道：“師弟，你編寫草藥醫學，一人之觀點，恐有些缺陷，剛好師兄我修造化之道，對這些有點研究，或可助你一臂之力。”
神農一聽大喜，不僅因爲以一人之力編寫醫藥之學，極爲艱難，更是神農有感自己一家之見，寫的書籍有些地方不好，恐誤人一生，因此早就想找個人指導，現在玄木自薦，神農自是喜出望外。
於是，神農就在玄木的幫助下，依據人族目前的情況，花費了數年的時間，重新整理了自己所學，終於編成了《神農本草經》一書。
《神農本草經》闡述了草木的毒、理、療三品分類及其入藥性能意義，藥物方劑中的君、臣、佐、使、引地位和作用，還有藥物的陰陽配合、七情合和、四氣五味、有毒無毒，以及藥物的採造，藥物的煎、煮、熬三法、藥物與病癥的關係等等，最後神農還將自己理解的基礎煉丹技巧寫在了上面。
《神農本草經》乃是人族第一本關於藥物與病理的系統書籍，開創了人類醫學的先河，神農因此被尊稱爲人族“醫祖”。
當這本書寫完的時候，天道有感，降下無量功德，讓玄木看得咋舌不已。八成功德落於神農身上，神農道行立馬連跳幾級，直接從大羅金仙后期上升到準聖後期，而神農鼎和赭鞭經神農嚐遍百草，吸收百草之精，本就發生了一些變化，現在融入功德後，立馬成爲極品先天靈寶中的佼佼者。
在玄木的幫助下，《神農本草經》比設想的完善了許多，因此有一成功德歸了玄木，玄木直接取出盤古鼎，吸收了這些功德，盤古鼎品質頓時又進了一步，終於成爲了頂級先天靈寶。玄木一看，頓時大喜，這盤古鼎本就爲通天成聖前煉製的最強法寶，並不弱於頂級先天靈寶，後來玄木遊歷洪荒時，不斷積累功德祭煉，盤古鼎成爲頂級先天靈寶亦在意料之中。
同時也有一團功德降下落於正在洪荒上游歷的通天身上，通天收取後，暗忖道：“神農已然證得大道，軒轅不久也將出世了，自己要收他爲徒，還需好生計較。”
而神農得了大功德後，只覺心中空靈一片，如今神農也是有大神通之人，心裡隱隱約約地知道自己不久後將離開人族，到火雲洞靜修。於是神農拜別玄木後，便回到陳都，一邊教授族人醫藥之術，一邊派人去洪荒尋找賢人來接替人族共主之位。
神農得道，整個天地都爲之慶賀，衆聖自然也知道，當下羨慕不已，便紛紛派遣弟子進入洪荒，尋找下一任人皇，自己則繼續以大寶窺視天機，關注人族變化。
而通天卻有些煩惱，這第三位人皇關係到三皇之數，實爲大道天機，比伏羲神農更是難找，又有四聖聯手擾動天機，那人皇相關之事更是模糊一片，幸虧通天從後世而來，知曉軒轅將出生在有熊部落，不然真的就毫無頭緒，只能靠運氣了。
然而眼下洪荒並無有熊部落，雖然通天派遣衆弟子明查暗訪幾十年，又有神農相助，依舊毫無收穫，只得吩咐衆弟子密切關注人族裡發生的異事。
地皇神農功德圓滿，軒轅終於即將應天數現世，很快弟子玄木就前來告知人族異事，通天一聽，不禁大喜，隨即取出混元劍，劃向虛空，卻是斬斷了這一線天機。
卻說在軒轅之丘有個人族部落名爲軒轅部落，其部落首領，姓姬，名少典，這少典有一夫人，叫附寶。有一天晚上，附寶見一道電光環繞著北斗樞星，隨即，那顆樞星就掉落了下來，附寶由此感應而孕。
姬少典雖然爲一普通凡人，但長期爲部落首領，經歷豐富，見識較廣，也聽說過伏羲神農誕生的神異之事，如今附寶有感北斗七星下墜而懷孕，生下的孩子日後定也是大賢之人，當下大爲高興。
這時有人進來道：“啓稟族長，門外有一道人前來拜訪。”
這個時候穿道袍的在普通人的印象中都是大神通者，因此少典忙派人請入，只見一消瘦年輕道人步入少典家中，見了少典，說道：“貧道稽首了。”正是通天。
少典忙回禮，禮畢，請通天上坐。通天也不謙讓，徑直坐下。
少典看著通天，只覺得非常熟悉，便問道：“不知道長是誰？今到此地，有何見諭？”
“貧道通天，此次前來，因與你孩子有師徒之緣。”通天言道。
少典一聽，再仔細一看通天，果然和廟裡供奉的聖父畫像相似，趕忙跪拜。原來軒轅部落只是是個小部落，部落廟裡供奉的聖父畫像，因爲年代久遠，又長久受那香薰，圖象已非常模糊，都知道通天大名卻不認識通天。
通天忙扶起他，說道：“不必多禮，貧道今日來是爲了收你孩子爲徒，不知你可願意？”
能見到聖父，少典已非常高興，又聽聖父專程前來收自己那未出世的孩兒爲徒，那裡有不允之理，忙吩咐附寶出來迎接。
通天看著附寶，隨即取出一顆混沌丹，以*化入胎盤，慢慢滋養胎兒，又一指，一道青光進入胎兒體內，卻是通天將自己對道的一點感悟傳給軒轅，通天如此做，卻是因爲日後軒轅要一統人族，行殺伐之道，修爲要足夠強，現在通天施展*，日後軒轅將會擁有一個良好的基礎，修煉將更爲迅速。
兩夫婦見得此番*，敬服不已。
如此，通天便在軒轅部落呆了下來，靜候那人皇降生。
通天就在軒轅部落行教化之事，雖然沒有干預人族自己的文明發展，但也傳下了不少強身健體之術，因此軒轅部落人人習武，個個身強力壯，幾可獵熊，於是少典稟明通天后，便將軒轅部落改名爲有熊部落，以紀念通天對軒轅部落的貢獻。
附寶之胎兒因那混沌丹之助，卻要孕育許久。
附寶懷孕三十年後，懷中小孩終於問世！
人皇出世，本來晦澀的天機頓時變得清晰明朗，三界有數的大神通者都立即感應到，諸位聖人身形一動，立刻穿越億萬裡虛空，趕往有熊部落。