卻說那日巫妖決戰，兩族皆盡出全力，打得洪荒破碎，不周山倒塌，天穹破裂。兩族損傷慘重，兩族倖存者只得聽從通天吩咐，龜縮在洪荒偏遠之地，不敢幹擾人族。
妖族去了北俱蘆洲，巫妖兩族乃是世仇，自然不願和妖族共處一洲，便就聚居在東勝神洲。
那次大戰，妖族裡大妖以上實力者全部身隕，而巫族卻倖存了一名大巫——蚩尤。這蚩尤早生洪荒，亦實力了得，僅次於夸父刑天之流，也有頂級大巫的實力，因此倖存下來的巫人皆以蚩尤爲首。
巫妖大戰極爲慘烈，蚩尤雖僥倖逃過一劫，但亦身受重傷，不得不閉關療傷，因此蚩尤命令族人不可侵犯人族，務必和人族搞好關係後，便閉關了。
如今祖巫俱喪，唯一的大巫又閉關療傷，羣龍無首之下，衆巫人只得夾起尾巴好好做人，在東勝神州南部盤古殿旁安頓下來，和當地人族之衆聚集在一起。
雖然巫族只倖存萬人，但巫人皆有天生神通，呼風喚雨、抓捕野獸在人族眼中的難事，對巫人卻是小事，而蚩尤又有命令，因此巫人經常照顧人族，周圍的人族生活自是蒸蒸日上，人族便對巫族感恩戴德。
巫族因此得到部分人族氣運，慢慢的發展起來。
爲了延續血脈，巫族便嘗試和人族通婚，而人族羨慕巫族強大，雙方一拍即合，倒是各取所需，成就了不少美滿姻緣。
人族繁育能力極強，巫人與人族結合後，果然生育變得容易許多，雖然後代大部分巫族血脈淡薄，十人最多就一人可成爲巫人，但這也遠比巫族自身繁育能力強，所以巫族開始大量的與人族生育後代，巫術也開始進入人類部落。
巫族和人族的融合，巫人自此散佈各人族部落，巫人因神通廣大，被人族尊稱爲巫師，在人族部落裡地位極高，掌握著人族大權。
漸漸的，巫族和人族混居形成熊、羆、貅、貙、虎、雕、鶡、鷹、鳶九個大部落，巫族稱之爲九黎部落。
經過了千多年來和人族的融合，九黎部落竟發展到近億之衆，而巫族也發展有了近百萬之衆！
巫族乃是天地間最好戰的種族，九黎部落人有巫族血脈，自是民風尚武。雖然很多人沒有成爲巫人，但有了點巫族血脈，也使得他們個個身強力壯，武藝高強。到後世，他們的後人機緣巧合之下，巫族血脈覺醒，領悟出一點巫族的天生神通，被凡人驚稱爲超能力。
巫族乃是盤古精血和開天濁氣所化，註定執掌洪荒殺戮，因此巫人個個彪悍無比，脾氣暴躁。九黎部落自然也不例外，不遵教化，性格蠻橫，稍有不順，即會怒氣沖天，拼死鬥毆。因此，天皇伏羲與地皇神農教化萬民，也沒有普及到九黎部落。
蚩尤爲巫族首領，自可聚齊巫族氣運，因此九黎部落之氣運盡系蚩尤一巫身上，九黎部落大興，蚩尤得的氣運越多。得氣運之助，蚩尤恢復極快，並破而後立，無限接近祖巫之境，卻是有了準聖中期巔峰的實力。
蚩尤出關後，衆巫人頓感有了主心骨，皆支持蚩尤做九黎部落首領。
蚩尤自然想要讓巫族重新在洪荒大興，但此時人族勢大，蚩尤又深深畏懼聖人之威，倒是不敢亂來，只是默默發展九黎部落。
蚩尤爲頂級大巫，自然比其他巫人更懂巫族功法，更有遠見。
巫族中就只有一名自己大巫，而部落裡又事物繁忙，自己行事不便，蚩尤又深感巫族實力弱小，便傳下頂級巫族功法，並挑選了八十一名資質極佳的巫人，賜下精血助他們修成大巫之身。於是自巫妖大戰以來，巫族又新生了大巫，不過比起遠古洪荒大巫自是遠遠不如。
蚩尤分封八十一名新大巫爲巫族長老，並派他們分管四方，而自己居中協調，九黎部落變得更有秩序，發展更加迅速。
蚩尤又命八十一名大巫將一些普通巫法傳給百姓，使百姓能夠改善體質，延長壽命；並煮海爲鹽，引進五穀六畜，改善了族人生活水平；如此等等，使蚩尤在九黎部落中威望更盛。周邊的部落聽聞後，紛紛前來投靠，九黎部落更是實力大增。
蚩尤爲九黎部落的發展作出了自己的貢獻，慢慢的便積累了一些功德，卻是因此得了一番機緣。
盤古殿中……
蚩尤剛剛修煉完畢，從入定中醒來，突然發現面前出現了一鬚髮皆白，手持柺杖的道人。
蚩尤大驚，盤古殿乃是十二大祖巫親自建造，殿中禁制、陣法無數，此人竟能在自己毫無所覺的情況下進來，可見此人定是不凡。蚩尤認真看了道人的打扮，心中一動，莫非是？
“拜見道教聖人，不知聖人此來有何貴幹？”蚩尤爲頂級大巫，自有巫族的尊嚴，雖明知太上老君的厲害，但是蚩尤卻也不會弱了自己的氣勢。
“呵呵！大巫蚩尤，好！”太上老君看蚩尤有禮有節，不由得讚歎。
太上老君輕聲說道。“你也勿須擔心，貧道此來乃是與你結一番善緣。”
“善緣？”蚩尤心裡驚疑不定。太上老君爲聖人，怎會搭理螻蟻般的準聖，莫非有不可告人的目的，蚩尤暗暗警惕。
太上老君道：“正是。貧道亦知道你心中抱負，我可助你成就大業。”
蚩尤大爲驚恐，沒想到聖人如此神通廣大，竟能知曉自己心事，莫非太上老君想早早消滅巫族這一隱患。後又聽到太上老君並不是要滅殺巫族，不禁鬆了一口氣。至於太上老君欲相助，蚩尤卻嗤之以鼻，聖人乃是大盜，以萬物爲棋子，若相信，定會遭聖人算計。
蚩尤久爲部落首領，不再是衝動魯莽之輩，知道太上老君來巫族，定會有所求，心中一番思量後問道：“我巫族實力弱小，又有聖人寬容，才得以茍延殘喘，豈敢再有那念想。”
太上老君聞言笑道：“當日乃是我師弟通天主張，當不得真，而你巫族乃是盤古大神精血所化，當有大機緣，如今軒轅無德，而九黎部落又實力強大，你可憑之爭奪人皇。”
要說蚩尤不心動，那是假的，蚩尤也曾想過憑藉九黎部落爭奪人皇，但軒轅爲通天教主之徒，與聖人相爭，那不是自找死路嗎？
太上老君當然看出了蚩尤的疑惑，笑道：“通天爲聖人，自有其他聖人應付，你不必顧忌。”
蚩尤心中一動，原來通天聖人勢大，其他聖人眼紅，欲對付人教了。聖人相爭，自己巫族倒是可以在夾縫中求得一線生機，說不得真能得了那人皇之位，畢竟九黎部落千萬百姓雖有巫族血脈，但也是人族之人，而人族之間相互撕殺爭鬥乃是常有之事，九黎部落和炎黃部落相爭，可算是人族內鬥，聖人亦干涉不得。
更重要的是，太上老君親自前來，若自己不答應，恐聖人惱怒之下，巫族頓時化爲灰灰。
聖人之爭，不似世俗，乃是道統，氣運之爭。蚩尤亦深知天下沒有白吃的晚餐，便道：“如若教主有助於我九黎部落，日後當奉道教一脈爲洪荒正統，傳道之處，巫族盡皆退避三舍，以示尊崇！”
太上老君一聽此言，差點沒被嚇一跳，這巫族開的條件實在太好了，如此一來，道教超過其他各教，成就洪荒第一教當指日可待。可惜巫族終究是福薄之輩，爲天道棄子，有如今成就已經是后土化輪迴之大功德庇護了，又豈能再做天地主角。
雖然心思百轉，太上老君仍自然地說道：“憑你之修爲欲成大事仍有些困難，貧道便成就你一番。”說完一指蚩尤，一道青光自指端射出。
蚩尤避之不及，如遭雷擊，身影一陣迷糊後，卻是身型暴長，終於進入準聖後期境界，晉升爲新的祖巫。
原來巫族只煉肉身，不修元神，不斬三尸，修爲越高，巫身越高，蚩尤方纔肉身暴長，正是巫族秘煉功法。
蚩尤恢復到正常大小，恭敬地向太上老君一拜，雖然太上老君有利用巫族之嫌，但相助自己卻是實實在在的。蚩尤亦震驚：這就是聖人的實力！
蚩尤倒是高估了太上老君，蚩尤本就幾欲突破，再加上管理九黎部落，積累了不少功德，太上老君不過是將功德引出來，並以*淬鍊一番大巫精血，使之升級爲祖巫精血。雖是臨門一腳，但亦不凡。
太上老君笑了笑，就消失在了盤古殿中，這般來去無影的神通又令蚩尤驚歎不已。
有了聖人支持，蚩尤信心大增，立即召集衆巫人。衆巫人在蚩尤身上感覺到濃厚的祖巫氣息，皆欣喜不已，認爲巫族復興有望。
蚩尤乃是第二個由大巫修成祖巫的巫人，更是如今僅存的祖巫，衆巫人如何不對他崇拜，蚩尤想帶領巫族恢復往日輝煌，而衆巫人等這一日已經等了一千多年，自然唯蚩尤之命是從。
蚩尤爲了準備和軒轅大戰，命令大巫加緊*練族人，並採集各種金屬煉製許多兵器，使得九黎部落戰力更加強悍。
太上老君和蚩尤一番舉動，通天自然看在眼裡，通天也沒有去阻攔，這巫族應天數而出，註定會和人族爭霸洪荒主角，即使蚩尤多番隱忍，巫族也會遭其他聖人算計。
當然通天也有自己的打算，天道設下大劫，這劫難越大，功德氣運就越大，通天自認勝券在握，自然願意這劫難加大。