一個(gè)神甫最后終于向匈牙利的馬提亞王通報(bào)了此事，后者開始對(duì)女伯爵的所作所為進(jìn)行調(diào)查。
搜查卻特城的行動(dòng)在1610年展開。12月30日，伯爵夫人的表兄圖爾索（匈牙利名gyythurso）伯爵，率領(lǐng)一隊(duì)士兵和騎兵包圍城堡。在臨攻破城堡的那一刻，堡里都還在進(jìn)行著血腥殘酷的殺戮。當(dāng)他們到達(dá)城堡時(shí)，所見到的場(chǎng)景比預(yù)計(jì)的要可怕：拿著劍的官吏，舉著火把走向城堡的地下室，異樣的氣味撲鼻而來。一個(gè)死去的少女倒在門廳，另一個(gè)已經(jīng)奄奄一息了，全身被刺滿了洞。另外一些則被吊在地下處刑室的天花板上，像被消化過的死鹿一般。
50多具尸體被從城堡地下發(fā)掘出來。往里去可以看到其他的尸體。也有還剩一口氣的活人。據(jù)生還者的證言，她們最后在沒有食物可以吃之時(shí)，被迫吃被殺的同伴的肉。男爵thurso和牧師janosponikenusz找到了那本在伊麗莎白臥室梳妝臺(tái)里的花名冊(cè)（牧師berthoni的日記），列著被屠殺的650多位少女的名字和被殺的細(xì)節(jié)（aadrasberthoni是csejthe村路德教會(huì)的一名牧師，當(dāng)伊麗莎白命令他將那些被吸干了血的尸體燒掉時(shí)，他意識(shí)到了事實(shí)的嚴(yán)重性，于是他將自己的懷疑和猜測(cè)在他去世前全部寫入了日記中）。
女伯爵的三個(gè)女巫同謀被抓去了，而女伯爵本人則被關(guān)在了自己的城堡中。
1610年，女伯爵和她的同伙被帶上了法庭。三個(gè)女巫在長(zhǎng)時(shí)間的嚴(yán)刑逼供后終于坦承了全部罪行，但是她們?cè)噲D減少她們?cè)谶@次恐怖事件中的重要程度。在17世紀(jì)的匈牙利，監(jiān)獄中的犯人是不可能獲得假釋的。三個(gè)人都把罪行推到了一個(gè)在審判前幾年就死去的同為女伯爵同謀的女巫身上。超過200個(gè)證人被傳喚到法庭，但是大多數(shù)人都只能提供一些道聽途說的消息做為證據(jù)。但是，這些供認(rèn)還是和馬提亞王和他的士兵所親眼見到的恐怖景象一樣，為法庭對(duì)女伯爵的定罪提供了足夠的證詞。
1611年1月，審判在匈牙利的bitcse（畢滋歇城）舉行。但伊麗莎白并未出庭應(yīng)訊，也沒有承認(rèn)任何罪行。
伊麗莎白不能出庭的原因不是出自她自己的選擇，事實(shí)上，她一直懇求逮捕她的馬提亞王替她開脫罪責(zé)。但是，對(duì)她來說很不幸的是，馬提亞王和她并沒有利益關(guān)系，將她的審判安排成向大眾公開。雖然有足夠的證據(jù)能夠證明她的罪行，我們還是得注意到她并沒有被允許出席她自己的審判并為自己辯護(hù)。
她的同謀比較慘些，沒有受到恩惠和寬恕。共犯尤娜和dorottyaszentes，手染基督徒之血的邪惡女巫，在她們被扔進(jìn)火堆之前，用燒的發(fā)紅的鉗子扯掉了所有的手指。另一個(gè)則被砍頭并且尸體被穿在了樹樁上。還有一個(gè)叫erszimajorova的女巫，則在遲些時(shí)候被砍頭。
由于受她的貴族出身所保護(hù)，伯爵夫人并沒有和她的同謀一樣下場(chǎng)悲慘。不過圖爾索（英文名thurzo）在1611年判她永遠(yuǎn)不得踏出她自己的城堡一步。有傳言說他是在”參觀“了那個(gè)受刑室之后做出如上判決的。（在拒絕擔(dān)當(dāng)隨軍牧師之職后，她被宣布判終身監(jiān)禁，要被關(guān)在城堡中直到死。）
判決確定后，石工就前往城里把所有的窗戶封死。她雖然活著，卻像被葬在巨大的黑暗的墳?zāi)怪幸话悖梢酝高^光線的地方，全部封死，不留一絲縫隙。最后為了要送食物和水到她的房間，才在墻上鑿了一個(gè)小洞。
所有的審判文件被深藏在古堡中，男爵圖爾索留在了城堡中。
1614年7月31日，54歲的伊麗莎白向來自esztergom教區(qū)的兩名牧師口述了她的最后愿望和遺囑，她希望她家庭的財(cái)產(chǎn)能夠在她的孩子中間平均分配，然而她的兒子保羅及其后代將是基本繼承者。
1614年8月14日，一個(gè)獄卒想好好看看這位女伯爵，因?yàn)閾?jù)說她當(dāng)時(shí)仍是匈牙利最美麗的女人之一，在那個(gè)小洞里瞥了一眼后，他發(fā)現(xiàn)她面朝下躺在地上，已經(jīng)死了。伊麗莎白·巴托里被關(guān)押的四年后，死在自己的那個(gè)小房間中。死時(shí)54歲。特蘭斯瓦尼亞的嗜血女伯爵終于在痛苦中死去了。她的尸體本應(yīng)葬在cachtice鎮(zhèn)教堂，但是當(dāng)?shù)鼐用駥?duì)把這位聲名狼藉的女士葬在他們的土地上十分不滿，更別說還要葬在神圣的地方了。考慮到這些，以及她是巴托利家族最后一代的事實(shí)，她的遺體被葬在了匈牙利的東北部城鎮(zhèn)ecsed，巴托利家族的領(lǐng)地上。
至死，她也沒有承認(rèn)過自己的罪行，也沒有對(duì)她的所做所為表示過懊悔。
這坐關(guān)押她的塔依然矗立于斯洛伐克共和國(guó)境內(nèi)。一本關(guān)于那次判罰的抄本今天還保存在布達(dá)佩斯的匈牙利國(guó)家檔案館中。度過漫長(zhǎng)的幾個(gè)世紀(jì)。
血腥瑪麗的原型為瑪麗一世（maryi，1516年2月18日~1558年11月17日），瑪麗一世（1553~1558年在位）成長(zhǎng)于歐洲宗教改革的洶涌大潮之中，其時(shí)英國(guó)也成為天主教和新教進(jìn)行殊死搏殺的場(chǎng)所。
她的母親凱瑟琳是一位篤信天主教的西班牙公主，而她的父親亨利八世為了達(dá)到與她母親離婚的目的，不惜背叛天主教，與羅馬教皇決裂，并在國(guó)內(nèi)扶持新教，迫害天主教徒。也許由于上述的成長(zhǎng)過程，也許源于她本人古板、固執(zhí)的性格，她成為了一個(gè)死硬的天主教徒，并對(duì)新教有著刻骨的仇恨。
成年后，她因?yàn)榫芙^改信新教而幾乎被亨利八世推上叛國(guó)的審判臺(tái)，后來又與當(dāng)時(shí)天主教世界的捍衛(wèi)者——西班牙國(guó)王菲利普二世結(jié)婚。登上王位后，她立即宣布恢復(fù)天主教，并對(duì)新教徒采取了高壓政策，屠殺其中的激進(jìn)分子，在她統(tǒng)治5年中，有300余人被燒死在火刑柱上，包括那個(gè)敢于宣布她父母的婚姻為無效、她為私生女的克蘭默大主教等，而被迫流亡國(guó)外的新教徒則不計(jì)其數(shù)。
她終于以其暴行獲得了英國(guó)人民對(duì)其“血腥瑪麗”的稱謂。她病死時(shí)，據(jù)說整個(gè)倫敦響起了歡慶的鐘聲，即位的就是她的妹妹、后來成為一代名君的伊麗莎白一世。